单细胞整合分析：从RNA-seq到蛋白质组学
单细胞RNA测序（RNA-seq）和单细胞蛋白质组学（single-cell proteomics）是探索细胞功能、异质性和生物学过程的两项核心技术，它们为解码生命现象提供了精确的数据。然而，单独依赖RNA-seq或蛋白质组学并不能完整描绘细胞的生物学特征，因为RNA水平并不总是与蛋白质表达及其功能
GPF-DIA和Direct DIA：哪个更适合大规模蛋白定量？
在大规模蛋白质组学研究中，数据独立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）技术因其高通量、高重现性和数据完整性，已成为主流。然而，DIA的发展也催生了多种策略，其中以GPF-DIA（Gas Phase Fractionation DIA）与Direct DIA（直接
SWATH-MS vs DDA-MS：哪种技术适合你的研究？
在蛋白组学研究中，选择合适的质谱采集方式是获得高质量数据的关键。目前，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ion spectra）与DDA-MS（Data-Dependent Acquisition）是
一文看懂 iTRAQ、SILAC 和无标记定量：有何区别与优劣？
在蛋白质组学研究中，蛋白质定量是理解生物系统动态变化的核心手段。随着质谱技术的发展，iTRAQ、SILAC 和无标记定量（Label-Free Quantification, LFQ）成为主流的三种定量策略。它们各具特点，适用于不同实验需求。 一、iTRAQ：异位标记，实现高通量多样本比较 1、原
无标记蛋白质组学必备分析工具：MaxQuant、DIA-NN全解析
无标记定量（Label-Free Quantification, LFQ）技术因其流程简便、成本相对低廉、适用范围广泛，在基础生物学研究、疾病机制解析及生物标志物发现中被广泛采用。然而，LFQ数据处理复杂，涉及大规模质谱数据的特征提取、定量计算、差异分析及功能注释，研究者对数据处理工具的选择与使用尤
使用OpenSWATH进行SWATH蛋白组学定量分析：完整流程解析
SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）作为基于数据独立采集（DIA）的质谱技术，近年来在蛋白组学研究中获得广泛应用。它以出色的重现性、高通量和广覆盖性，成为大规模样本定量分析的重要技术选择。而Op