16S/18S/ITS等扩增子测序
利用二代高通量测序技术，对微生物的16S rDNA及ITS高变区域，分析环境中的细菌、古细菌以及真菌的种类组成和构成，揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度、进化关系，进一步探讨微生物多样性。
甲基化检测
DNA甲基化是一种表观遗传修饰，它是由DNA甲基转移酶（DNA methyl-transferase, Dnmt）催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体，将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶（mC）的一种反应，在真核生物DNA中，5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基。CG二核苷酸是最主要的甲基化位点，它在基
全基因组重测序（变异位点 遗传进化 基因预测）
全基因组范围内查找个体或群体间DNA水平各种类型的变异，进行遗传进化分析；通过单体型预测，进行全基因组关联分析（GWAS）。