真核mRNA测序
真核mRNA转录组测序是借助新一代高通量测序技术，以真核细胞在某一功能状态下所能转录出的全部mRNA为研究对象，全面了解该生物样品在特定时空下基因的表达情况。
基因组测序
技术简介基因组测序分为de novo测序和重测序。de novo 测序即从头测序，不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序；基因组重测序是对有参考基因组物种的不同个体进行的基因组测序
小RNA测序(miRNA-seq)
小RNA测序技术采用胶分离技术，收集样品中18-30nt的RNA片段，利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息
微生物基因组重测序
全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序，并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。重测序能够检测全基因组的罕见变异，可获得大量的单核苷酸多态性（SNP）信息、序列的插入缺失位点信息。
RAD-Seq
基于酶切的简化基因组测序（RAD-Seq，Restriction-site Associated DNA Sequence）是对与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA进行高通量测序。
真菌基因组测序（比较基因组 基因功能 基因注释）
真菌属于较低等的真核生物，基因组较小；真菌基因组的测序将为真菌特性的分析提供有用的依据；随着新一代高通量技术的成熟，真菌基因组测序成本已大大降低。
宏基因组测序及分析
宏基因组测序，是将环境样品中的微生物群落基因组作为一个整体，进行高通量测序分析，从而对环境中微生物菌群的多样性、丰度以及功能活性进行解读，进而探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系；